Nadrzędnym celem projektu jest powstrzymanie pogorszenia jakości lub zaniku siedlisk i gatunków będących przedmiotami ochrony poszczególnych obszarów Natura 2000 położonych w obrębie Zalewu Szczecińskiego. Problemy środowiskowe zidentyfikowano w oparciu o analizę potrzeb planów zadań ochronnychdla obszarów Natura 2000 a także na podstawie zapisów w standardowych formularzach danych (SDF). Partnerzy projektu podejmują transgraniczną współpracę na rzecz poprawy stanu środowiska, w szczególności zachowaniu i rozwojowi różnorodności biologicznej w rejonie delty Odry (OD), który pełni kluczową rolę dla migracji wielu cennych gatunków ptaków, ssaków i ryb. Np. Łosoś, troć wędrowna i jesiotr swe najbliższe dostępne obszary rozrodu mogłyby mieć w dopływach Zalewu Szczecińskiego, łącznika między słodkowodnymi rzekami, a Bałtykiem.